Вернуться к статье
Преодоление разрыва между генотипом и фенотипом: интеграция полногеномных ассоциативных исследований и вычислительной структурной биологии для расшифровки механизмов неправильного фолдинга белков, вызванного однонуклеотидными полиморфизмами, при заболеваниях человека
Workflow for Computational Design of p53 Stabilizers
a schematic: 1) p53-Y220C mutant structure with the cavity highlighted; 2) in silico screening of compound collections (known drugs, natural compounds databases); 3) molecular docking of compounds into the cavity; 4) post-docking analysis: binding pose evaluation, interaction diagrams (H-bonds, van der Waals contacts); 5) estimation of the stabilization effect (ΔΔG upon binding); 6) result: experimental validation top hit compounds (e.g., by DSF, cellular assays)