Вернуться к статье

Преодоление разрыва между генотипом и фенотипом: интеграция полногеномных ассоциативных исследований и вычислительной структурной биологии для расшифровки механизмов неправильного фолдинга белков, вызванного однонуклеотидными полиморфизмами, при заболеваниях человека

Table 1 - Results from Key Computational Case Studies

Gene

Key Variant

Predicted ΔΔG (kcal/mol)

Key Structural Consequence (from MD/Modeling)

Predicted Disease Link

Study

RTEL1

G100R

-4.8

Disruption of H-bond network, increased flexibility in DNA-binding domain

Cancer, Telomere disorders

Tanshee et al.

MLH1

R659P

-3.2

Destabilization of core domain, loss of salt bridge with D699

Lynch Syndrome

Gund et al.

NBN

F90L

-2.1

Perturbation of hydrophobic core, increased solvent accessibility

Nijmegen Breakage Syndrome

Gund et al.

Multiple

N/A

N/A

Network-level finding: Pathogenic variants in hubs confer significant

Various Cancers

Reza et al.