Locus

Primer

Product length (bp)

Dimers (kcal/mol;bp)

Hairpin

(kcal.mole; oC)

Gy1

F: GCAAGAGCAAGGAGGTCATC

R: TTGCACTGTGGCTTCTCATC

285

Homo-dimer

F: -3,14;2

R: -7,05;4

Hetero-Dimer

-7,04;4

F: -1.01;42,3

R: -0.82;36.1

Gy2

F: AGCCAGAAAGGAAAGCAACA

R: GGCACTGAGTTTGAGAAGCC

444

Homo-dimer

F: -3,14;2

R: -6,21;3

Hetero-Dimer

-6,21;3

F: -1.51;52,3

R: -0,94;39,2

Gy3

F: CGAAGCCACCTTACACCATT

R: GGCTTGTTGTTAGGGTTCCA

392

Homo-dimer

F: -3,61;2

R: -3,14;2

Hetero-Dimer

-9.75;5

F: -0,12;27

R: 0,23;21,2

Gy4

F: GCTTGGTCGACTAGGACGAG

R: CTCCAGACGACGAAAGGAAG

221

Homo-dimer

F:-9,45;6

R: -4,64;3

Hetero-Dimer

-6,53;4

F: -0,91;37,5

R: -0,27;29,9

Gy5

F: CAACAGCAGCAGCAGAAGAG

R: CACGTGGTTCTTGTTGTTCG

403

Homo-dimer

F: -3,14;2

R: -10,2;6

Hetero-Dimer

-7,19;5

F: -2,23;57.4

R: -0,1;26,3

Gy7

F: CACCCTTGGAACACGAAGTT

R: GTTGAATATGTCGGCGTGTG

392

Homo-dimer

F: -3,61;2

R: -3,91;4

Hetero-Dimer

-8.25;5

F: -0,98

R: 0,45;18

Cg-1

F: TGCTGGGACTTGTTTTCCTGGCT R: ACTCCCTCTTGCTGCCTCTGCT

1096

Homo-dimer

F: -4,64;3

R: -3,14;2

Hetero-Dimer

-7,71;4

F: -3,12;47,6

R: -1,09;40,3

Cg-3

F: GCTGGGAGTTGTTTTCCTGGCA

R: TTGGTGTGGGCGTGGGTGTT

430

Homo-dimer

F: -4,46;3

R: -3,61;2

Hetero-Dimer

-3,14;2

F: -3;48

R: -1,12;5

Cg-4

F: ACTCCTACAACCTTCACCCTGGCG

R: ACTCCCTCTTGCTGCCTCTGCT

286

Homo-dimer

F: -3,61;2

R: -3,14;2

Hetero-Dimer

-6,21;3

F: -0,09;26,3

R: -1,09;40,3