Вернуться к статье

Анализ дифференциальной экспрессии DREB- и ауксин-зависимых генов у Quercus robur L. в условиях засухи

Таблица 1 - Ключевые гены семейств DREB и Aux/IAA: дифференциальная экспрессия (edgeR) и роль в сети WGCNA

Примечание: * между группами засуха/контроль, ** между группами полив/контроль

ID гена

Семейство

Сетевой статус

log₂FC*

FC*

FDR*

log₂FC **

FC **

FDR**

Биологическая роль

LOC126700339

DREB

Хаб (9 связей)

-1,36

0,39

0,004

0,35

1,27

0,12

Конститутивный регулятор, предадаптация

LOC126700341

DREB

Хаб (9 связей)

-1,32

0,41

0,008

0,28

1,21

0,15

Тандемный DREB-хаб Chr6

LOC126708900

DREB

Хаб (8 связей)

-2,39

0,19

0,002

-0,45

0,74

0,32

DREB2A-подобный, глубокая репрессия

LOC126705463

DREB

Хаб (7 связей)

-1,45

0,37

0,015

0,12

1,09

0,45

Связывание DRE/CRT элементов

LOC126725348

Aux/IAA

Хаб (10 связей)

-1,78

0,29

0,042

+1,22

2,33

0,032

Центральный регулятор роста/защиты

LOC126710403

Aux/IAA

Центральный хаб

-2,5

0,18

<0,001

-0,67

0,63

0,089

Гормональный гомеостаз

LOC126710507

DREB

Мажорный лидер

-0,15

0,9

0,85

0,08

1,06

0,872

Высокая конститутивная экспрессия

LOC126717446

Aux/IAA

Лидер (засуха)

+2,55

5,86

0,048

0,92

1,89

0,21

Стресс-индуцируемый

LOC126710489

Aux/IAA

Лидер (контроль)

-0,42

0,75

0,32

0,45

1,37

0,41

Ауксиновый сигналинг

LOC126703153

Aux/IAA

Конститутивный

-0,28

0,82

0,56

0,31

1,24

0,38

Стабильная экспрессия