Сравнительный анализ DUF1471-содержащих белков Serratia marcescens SM6
Таблица 1 - Сравнение белков S. marcescens, содержащих DUF1471 домен с белками Salmonella Typhimutium LT2, Escherichia coli K-12 MG1655 и Yersinia pestis KIM10+
Локус | Белок | Размер, а.о. | Степень гомологии известными DUF1471-содержащими белками | Предлагаемое название | ||
Salmonella Typhimutium LT2 | Escherichia сoli K-12 MG1655 | Yersinia pestis KIM10+ | ||||
EG355_00520 | TBU70968 | 87 | 56% идентичности, 74% сходства к белку YhcN (STM3361); 49% идентичности, 68% сходства к белку STM3362; 45% идентичности, 57% сходства к белку SrfN (STM0082); 30% идентичности, 48% сходства к белку YahO (STM0366) | 61% идентичности, 79% сходства к белку YhcN (b3238); 41% идентичности, 63% сходства к белку YjfY (b4199); 36% идентичности, 56% сходства к белку McbA (b0806)
| 38% идентичности, 56% сходства к белку AAM87453.1 (y3909) | YhcN |
EG355_00525 | TBU70861 | 87 | 53% идентичности, 75% сходства к белку YhcN (STM3361); 49% идентичности, 68% сходства к белку STM3362; 42% идентичности, 59% сходства к белку SrfN (STM0082); 35% идентичности, 54% сходства к белку YahO (STM0366); 36% идентичности, 54% сходства к белку YdgH (STM1478) | 54% идентичности, 77% сходства к белку YhcN (b3238); 42% идентичности, 61% сходства к белку YjfY (b4199) | 36% идентичности, 59% сходства к белку AAM87453.1 (y3909) | YhcN_2 |
EG355_00635 | TBU70881 | 88 | 32% идентичности, 57% сходства к белку YhcN (STM3361) | 31% идентичности, 56% сходства к белку YhcN (b3238); 34% идентичности, 52% сходства к белку YjfN (b4188) | Значительной гомологии не обнаружено | YhcN_3 |
EG355_00650 | TBU70884 | 102 | 57% идентичности, 67% сходства к белку BsmA (STM4379); 39% идентичности, 44% сходства к белку YjfN (STM4378) | 57% идентичности, 69% сходства к белку BsmA (b4189); 37% идентичности, 48% сходства к белку YjfN (b4188) | 62% идентичности, 81% сходства к белку AAM84228.1 (y0640); 36% идентичности, 54% сходства к белку AAM87453.1 (y3909) | BsmA |
EG355_00655 | TBU70885 | 91 | 54% идентичности, 70% сходства к белку YjfN (STM4378) | 48% идентичности, 60% сходства к белку YjfN (b4188) | Значительной гомологии не обнаружено | YjfN |
EG355_05865 | TBU70217 | 86 | 52% идентичности, 65% сходства к белку BhsA (STM1214); 58% идентичности, 66% сходства к белку YbiJ (STM0823) | 51% идентичности, 65% сходства к белку BhsA (b1112) | Значительной гомологии не обнаружено | BhsA_2 |
EG355_06280 | TBU70295 | 85 | 54% идентичности, 65% сходства к белку BhsA (STM1214); 36% идентичности, 64% сходства к белку YhcN (STM3361); 28% идентичности, 48% сходства к белку YahO (STM0366) | 55% идентичности, 68% сходства к белку BhsA (b1112); 29% идентичности, 50% сходства к белку YahO (b0329) | 29% идентичности, 52% сходства к белку AAM87453.1 (y3909) | BhsA_3 |
EG355_06285 | TBU70296 | 85 | 55% идентичности, 70% сходства к белку BhsA (STM1214); 53% идентичности, 72% сходства к белку YbiJ (STM0823) | 54% идентичности, 69% сходства к белку BhsA (b1112) | Значительной гомологии не обнаружено | BhsA |
EG355_06285 | TBU68018 | 316 | 70% идентичности, 83% сходства к белку YdgH (STM1478); 28% идентичности, 59% сходства к белку YhcN (STM3361); 29% идентичности, 52% сходства к белку STM3362 | 70% идентичности, 83% сходства к белку YdgH (b1604) | Значительной гомологии не обнаружено | YdgH |
EG355_08300 | TBU70671 | 94 | 43% идентичности, 57% сходства к белку YjfN (STM4378); 29% идентичности, 59% сходства к белку YdgH (STM1478) | 36% идентичности, 47% сходства к белку YjfN (b4188); 35% идентичности, 60% сходства к белку YjfY (b4199) | 35% идентичности, 51% сходства к белку AAM84228.1 (y0640) | YjfN_2 |
EG355_09650 | TBU68088 | 86 | 60% идентичности, 70% сходства к белку YbiJ (STM0823); 38% идентичности, 54% сходства к белку YhcN (STM3361) | 57% идентичности, 68% сходства к белку YbiJ (b0802) | Значительной гомологии не обнаружено | YbiJ |
EG355_19345 | TBU67220 | 94 | 47% идентичности, 68% сходства к белку SrfN (STM0082); 42% идентичности, 62% сходства к белку YahO (STM0366); 38% идентичности, 54% сходства к белку YhcN (STM3361); 31% идентичности, 55% сходства к белку STM3362 | 39% идентичности, 61% сходства к белку YahO (b0329); 38% идентичности, 54% сходства к белку YhcN (b3238) | 60% идентичности, 74% сходства к белку AAM87453.1 (y3909) | SrfN |
EG355_21810 | TBU66869 | 86 | 45% идентичности, 62% сходства к белку BhsA (STM1214); 48% идентичности, 63% сходства к белку YbiJ (STM0823) | 45% идентичности, 62% сходства к белку BhsA (b1112); 38% идентичности, 56% сходства к белку McbA (b0806); 48% идентичности, 63% сходства к белку YbiJ (b0802); 34% идентичности, 51% сходства к белку YhcN (b3238) | Значительной гомологии не обнаружено | YbiJ_2 |
EG355_21825 | TBU66872 | 70 | Значительной гомологии не обнаружено | 36% идентичности, 52% сходства к белку YhcN (b3238) | Значительной гомологии не обнаружено |
|