Сравнительный анализ DUF1471-содержащих белков Serratia marcescens SM6
Таблица 1 - Белки с доменом DUF1471 грамотрицательных бактерий порядка Enterobacterales
Организм | Локус | Белок | Размер, а.о. | Известная функция | Ссылки на работы |
Salmonella Typhimurium LT2 | STM0082 | SrfN | 96 | Необходим для вирулентности
| , , |
STM0366 | YahO | 91 | Необходим для вирулентности. Экспрессия повышается в средах с низким рН | , | |
STM0565 | STM0565 | 78 | Экспрессия понижается в средах с добавлением перекиси водорода | ||
STM0823 | YbiJ | 86 | Активируется в присутствии DHMA (3,4-дигидроксиминдальной кислоты). Может участвовать в приобретении железа |
| |
STM1214 | YcfR | 85 | Известен как белок множественной устойчивости к стрессу. Делеция ycfR вызывает структурные изменения липополисахаридов и дестабилизирует целостность оболочки. Мутант, лишенный гена ycfR также имеет сниженную подвижность и его вирулентность снижается. Необходим для образования биопленок | , , , , | |
STM1478 | SssB/YdgH | 314 | Участвует в патогенезе. У мутанта с делецией гена ydgH/sssB значительно ослабляется вирулентность у мышей | ||
STM3361 | YhcN | 87 | Активируется при стрессе, индуцированным хлором | ||
STM3362 | STM3362 | 88 | Функция неизвестна |
| |
STM4378 | YjfN | 106 | Функция неизвестна |
| |
STM4379 | BsmA | 109 | Функция неизвестна |
| |
STM4389 | YjfY | 91 | Функция неизвестна |
| |
Yersinia pestis KIM | y3909 | AAM87453.1 | 92 | Транскрипция гена y3909 значительно увеличивается при кислом pH 4,5, но делеция y3909 не снижает толерантность к кислоте | |
y1667 | AAM85236.1 | 86 | Экспрессия y1667 увеличивается при заражении блох. Делеция гена снижает способность формировать биопленки при пониженных значениях pH среды | ||
y0640 | AAM84228.1 | 53 | Функция неизвестна |
| |
y2136 | AAM85698.1 | 317 | Функция неизвестна |
| |
y0666 | AAM84254.1 | 87 | Необходим для адаптации к стрессу, вызванному низким pH среды. Транскрипция y0666 значительно увеличивается с повышением кислотности среды | ||
Escherichia coli K-12 | b4199 | YjfY | 91 | Повышенно экспрессируется при формировании биопленок в моче человека | |
b0329 | YahO | 91 | Делеция гена yahO увеличивает чувствительность к рентгеновскому и ультрафиолетовому излучению. Может быть вовлечен в устойчивость к высоким значениям pH среды | , | |
b0806 | McbA (YbiM) | 86 | Экспрессия McbA репрессируется McbR. Удаление McbR делает возможной экспрессию, что приводит к перепроизводству колановой кислоты, вызывая мукоидию, что предотвращает образование биопленок | ||
b4189 | BsmA (YjfO) | 109 | Влияет на образование биопленок в ответ на стресс | ||
b0802 | YbiJ | 86 | У мутантов с удаленным геном YbiJ существенно снижается способность формировать биопленки в человеческой моче. Снижается подвижность на чашках с агаром, содержащим мочу | ||
b0303 | RclB | 78 | Необходим для выживания в условиях стресса, вызванного хлором в среде | ||
b3238 | YhcN | 87 | Связан с реакцией на окислительный и кислотный стресс и с образованием биопленок | ||
b1112 | BhsA (YcfR) | 85 | Необходим для колонизации поверхности листьев салата и формирования биопленок. Индуцируется воздействием перекиси водорода и во время роста биопленок и при воздействии различных факторов стресса, включая кадмий, медь и тепловой шок | , , | |
b4188 | YjfN | 91 | Положительно регулируется в ответ на стресс и является активатором DegP, консервативной протеазы, служащей для удаления неправильно уложенных белков в периплазме. Суперэкспрессия YjfN повышает жизнеспособность клеток при стрессе, вызванном неправильно уложенными белками | ||
b1604 | YdgH | 314 | Функция неизвестна |
| |
Serratia marcescens SM6 | EG355_00520 | TBU70968 | 87 | Функция неизвестна |
|
EG355_00525 | TBU70861 | 87 | Функция неизвестна |
| |
EG355_00635 | TBU70881 | 88 | Функция неизвестна |
| |
EG355_00650 | TBU70884 | 102 | Функция неизвестна |
| |
EG355_00655 | TBU70885 | 91 | Функция неизвестна |
| |
EG355_05865 | TBU70217 | 86 | Функция неизвестна |
| |
EG355_06280 | TBU70295 | 85 | Функция неизвестна |
| |
EG355_06285 | TBU70296 | 85 | Функция неизвестна |
| |
EG355_06285 | TBU68018 | 316 | Функция неизвестна |
| |
EG355_08300 | TBU70671 | 94 | Функция неизвестна |
| |
EG355_09650 | SrfN (TBU68088) | 86 | Необходим для выживания бактерии в условиях кислотного и оксидативного стрессов | ||
EG355_19345 | TBU67220 | 94 | Функция неизвестна |
| |
EG355_21810 | TBU66869 | 86 | Функция неизвестна |
|