Вернуться к статье

Сравнительный анализ DUF1471-содержащих белков Serratia marcescens SM6

Таблица 1 - Белки с доменом DUF1471 грамотрицательных бактерий порядка Enterobacterales

Организм

Локус

Белок

Размер, а.о.

Известная функция

Ссылки на работы

Salmonella Typhimurium LT2

STM0082

SrfN

96

Необходим для вирулентности

 

 

,

STM0366

YahO

91

Необходим для вирулентности. Экспрессия повышается в средах с низким рН

,

STM0565

STM0565

78

Экспрессия понижается в средах с добавлением перекиси водорода

STM0823

YbiJ

86

Активируется в присутствии DHMA (3,4-дигидроксиминдальной кислоты). Может участвовать в приобретении железа

 

STM1214

YcfR

85

Известен как белок множественной устойчивости к стрессу. Делеция ycfR вызывает структурные изменения липополисахаридов и дестабилизирует целостность оболочки. Мутант, лишенный гена ycfR также имеет сниженную подвижность и его вирулентность снижается. Необходим для образования биопленок

,
,
,
,

STM1478

SssB/YdgH

314

Участвует в патогенезе. У мутанта с делецией гена ydgH/sssB значительно ослабляется вирулентность у мышей

STM3361

YhcN

87

Активируется при стрессе, индуцированным хлором

STM3362

STM3362

88

Функция неизвестна

 

STM4378

YjfN

106

Функция неизвестна

 

STM4379

BsmA

109

Функция неизвестна

 

STM4389

YjfY

91

Функция неизвестна

 

Yersinia pestis KIM

y3909

AAM87453.1

92

Транскрипция гена y3909 значительно увеличивается при кислом pH 4,5, но делеция y3909 не снижает толерантность к кислоте

y1667

AAM85236.1

86

Экспрессия y1667 увеличивается при заражении блох. Делеция гена снижает способность формировать биопленки при пониженных значениях pH среды

y0640

AAM84228.1

53

Функция неизвестна

 

y2136

AAM85698.1

317

Функция неизвестна

 

y0666

AAM84254.1

87

Необходим для адаптации к стрессу, вызванному низким pH среды. Транскрипция y0666 значительно увеличивается с повышением кислотности среды

Escherichia coli K-12

b4199

YjfY

91

Повышенно экспрессируется при формировании биопленок в моче человека

b0329

YahO

91

Делеция гена yahO увеличивает чувствительность к рентгеновскому и ультрафиолетовому излучению. Может быть вовлечен в устойчивость к высоким значениям pH среды

,

b0806

McbA (YbiM)

86

Экспрессия McbA репрессируется McbR. Удаление McbR делает возможной экспрессию, что приводит к перепроизводству колановой кислоты, вызывая мукоидию, что предотвращает образование биопленок

b4189

BsmA (YjfO)

109

Влияет на образование биопленок в ответ на стресс

b0802

YbiJ

86

У мутантов с удаленным геном YbiJ существенно снижается способность формировать биопленки в человеческой моче. Снижается подвижность на чашках с агаром, содержащим мочу

b0303

RclB

78

Необходим для выживания в условиях стресса, вызванного хлором в среде

b3238

YhcN

87

Связан с реакцией на окислительный и кислотный стресс и с образованием биопленок

 

b1112

BhsA (YcfR)

85

Необходим для колонизации поверхности листьев салата и формирования биопленок. Индуцируется воздействием перекиси водорода и во время роста биопленок и при воздействии различных факторов стресса, включая кадмий, медь и тепловой шок

,
,

b4188

YjfN

91

Положительно регулируется в ответ на стресс и является активатором DegP, консервативной протеазы, служащей для удаления неправильно уложенных белков в периплазме. Суперэкспрессия YjfN повышает жизнеспособность клеток при стрессе, вызванном неправильно уложенными белками

b1604

YdgH

314

Функция неизвестна

 

Serratia marcescens SM6

EG355_00520

TBU70968

87

Функция неизвестна

 

EG355_00525

TBU70861

87

Функция неизвестна

 

EG355_00635

TBU70881

88

Функция неизвестна

 

EG355_00650

TBU70884

102

Функция неизвестна

 

EG355_00655

TBU70885

91

Функция неизвестна

 

EG355_05865

TBU70217

86

Функция неизвестна

 

EG355_06280

TBU70295

85

Функция неизвестна

 

EG355_06285

TBU70296

85

Функция неизвестна

 

EG355_06285

TBU68018

316

Функция неизвестна

 

EG355_08300

TBU70671

94

Функция неизвестна

 

EG355_09650

SrfN

(TBU68088)

86

Необходим для выживания бактерии в условиях кислотного и оксидативного стрессов

EG355_19345

TBU67220

94

Функция неизвестна

 

EG355_21810

TBU66869

86

Функция неизвестна